急诊科创建于1993年，是福州市第一批“120”急救联动单位之一，担负本部及东二环分院辖区内居民卫生应急救援任务，年出诊量约6000余车次。科室专业技术力量雄厚，拥有专职医护人员67人，其中主任医师2人、副主任医师4人、主治医师5人、住院医师13人、主管护师10人、硕士学位13人、研究生导师1人。成立了心血管急救学组、脑病神志专业学组、呼吸感染学组、中毒急救学组、创伤急救学组5个亚专科学组。多年的发展，已成为国家中医药管理局中医专科诊疗中心急诊专科联盟、福建省急诊医学联盟、福建危急重症超声联盟成员单位、岭南中医急诊医疗联盟等联盟成员单位。2023年，急诊科被确定为福建省省级临床重点专科建设项目单位。

科室已建成“院前急救、院内抢救、重症监护”三位一体的急救医疗模式，开设了急诊抢救单元9张，急诊监护、留观、住院病床共20张，具有很强的处置急危重症患者的能力，如心跳呼吸骤停、多脏器功能衰竭、呼吸衰竭、心力衰竭、重症感染、重症胰腺炎、急性消化道出血、急性中毒、热射病、多发伤等均能得到快速有效救治。由国家授牌成立的“胸痛中心”、“卒中中心”绿色通道均落地于急诊科，与120联动，大大提高了胸痛、卒中病人抢救成功率。

科室目前建立了咳嗽（感冒后咳嗽或感染后咳嗽）、泄泻（急性肠炎）、眩晕、胸痹（冠心病、心绞痛）、胃脘痛（急性胃炎）5个优势病种，配备有中医综合治疗室，并将针灸、刮痧、拔火罐、穴位注射、耳穴埋豆、中药雾化吸入、贴敷疗法等中医特色诊疗技术应用于临床急救，提高了危重症抢救的效率。

科室先后被评为“福建省五四青年奖章青年卫士团队”、“省级青年文明号”、“福建省总工会工人先锋号”、“福建省三八红旗集体”、“福建爱岗敬业好青年集体”等称号。