肾病科病房床位47张，是“全国中医医院优质护理先进病房”、省直“青年文明号”。专科医务人员50余名，其中各级医师16名，以肾脏病中西医结合诊疗及慢病管理作为业务发展方向，以慢性肾衰（慢性肾衰竭）、肾水（原发性肾病综合征）、慢肾风（慢性肾小球肾炎）、急性肾盂肾炎（肾瘅病）为四大优势病种。尤其在慢性肾衰方面，已经形成一套成熟的中西结合诊疗方案，相关研究成果丰富。

专科有两个亚专科：1、腹膜透析中心，是全国中医腹膜透析联盟成员单位，拥有2台自动化腹膜透析机。腹膜透析技术是本专科传统强项之一，包括全面开展腹透充分性评估、自动化腹膜透析、腹膜平衡试验、定期电话微信随访教育，开设腹透护士专科门诊等措施，开展至今累计完成600多例腹透，位于全省各医疗单位前列，腹透各项质量评价指标均在省内处领先地位，并正开展中医药干预腹膜透析的研究。2、血液透析中心，具有丰富血透经验的医护人员20多位，装备有48台先进血透机，相关配套设施齐全，年透析近三万人次。在省内首家开展钝针穿刺技术，专科规模及穿刺技术水平在省内处于领先水平。主要研究血液透析患者的管理，包括血液透析并发症的处理及血管通路的管理，是福建省血液净化专科护理培训基地。

专科开展祛毒灌肠液保留灌肠、结肠水疗、穴位疗法等中医特色疗法，并创制了具有独特疗效的专科院内制剂（补肾祛毒丸、祛毒灌肠液、肾血宁胶囊）。是国家中医药管理局“高血压肾病”中医指南制定牵头单位。近3年科研课题6项，发表论文20多篇，其中《补肾祛毒汤对腺嘌呤肾衰大鼠肾脏 TGF-β1、HGF表达的干预作用》获得福建省自然科学优秀学术论文三等奖。“补肾祛毒汤治疗慢性肾功能衰竭的临床与基础研究”获2016年福建医学科技奖（恒瑞杯）三等奖。